Inicialmente nombrada Acadeima de Jóvenes Guardias Marinas, por Bernardo O'Higgins, ante la necesidad de establecer un plantel de oficiales de marina que conduciera las operaciones navales.

El período de la dictadura militar en Chile se extiende desde el golpe de Estado del 11 de septiembre de 1973, que puso fin al gobierno de Salvador Allende, hasta el 11 de marzo de 1990, fecha en que asume la presidencia Patricio Aylwin Azócar, inaugurando la transición a la democracia.
Tras el derrocamiento del gobierno, una Junta Militar asumió el poder, estableciendo un régimen autoritario. Trece días después del golpe, mediante el Decreto Ley N° 27, se disolvió el Congreso Nacional, se pusieron en receso los partidos políticos y se instauró el Estado de Sitio en todo el país. La Junta Militar justificó que asumía la labor legislativa para "acelerar el cumplimiento de sus funciones". Además, el 13 de septiembre de 1973, se declaró la caducidad de todos los registros electorales del país, aduciendo la "comprobada existencia de graves y extendidos fraudes electorales".
La Junta Militar, que gobernó el país hasta 1990, estuvo inicialmente integrada por: General Augusto Pinochet Ugarte, Comandante en Jefe del Ejército. Entre 1973 y 1978, Pinochet consolidó su poder sobre los demás miembros de la Junta; General Gustavo Leigh Guzmán, Comandante en Jefe de la Fuerza Aérea; Almirante José Toribio Merino Castro, Comandante en Jefe de la Armada; General César Mendoza Durán, General Director de Carabineros.

Fue un marino con rango de contraalmirante y contador general chileno. Se desempeñó como ministro de Hacienda durante la dictadura militar del general Augusto Pinochet, desde septiembre de 1973 hasta julio de 1974.

El Comando Conjunto fue una organización clandestina de inteligencia de la dictadura militar chilena, que persiguió y ejecutó a opositores del régimen de Augusto Pinochet. Operó entre 1975 y 1976, periodo en el cual secuestró, torturó e hizo desaparecer al menos a treinta personas, casi todas ellas dirigentes del Partido Comunista de Chile. Funcionó de facto —sin una formalización institucional como sí lo hizo la DINA— bajo el alero de la Dirección de Inteligencia (DIFA) de la Fuerza Aérea de Chile (FACh), pero también tuvo en sus filas a integrantes del Ejército, la Armada, Carabineros y civiles que habían pertenecido al grupo paramilitar de extrema derecha Patria y Libertad.
La existencia del aparato represor se reveló públicamente en 1984, luego de que el suboficial de la FACh Andrés Valenzuela Morales desertara de la institución y confesara a la periodista Mónica González de la revista Cauce su participación en las desapariciones forzadas que realizaba el Comando Conjunto. Su testimonio, publicado en diciembre de ese año, permitió conocer por primera vez en forma detallada los vejámenes y torturas a los cuales fueron sometidas víctimas de la dictadura militar, y los métodos empleados para hacerlas desaparecer.

Militar chileno, comandante en jefe de la Armada.